丁肝新一代测序，法国科学家研发，可量化HDV编辑率检测技术

　　丁肝病毒（HDV），这是一种小且有着缺陷的RNA病毒，需要乙肝病毒（HBV）的包膜蛋白，才可以形成自己的病毒体。法国科学家在科学杂志《Viruses》上介绍，了解体内病毒编辑率的动力学，是解开病毒生物学和了解其传播与自然历史的关键。

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我们开发并验证了，一种基于新一代测序的新检测方法，旨在量化血浆之中的HDVRNA编辑。在本研究中，法国科学家分析了219名感染了不同HDV基因型患者的血浆样本，结果表明，HDV编辑能力在很大程度上，取决于该菌株的基因型。

　　RNA编辑，负责从病毒RNA复制到病毒粒子包装与分泌的转变。事实上，在早期复制周期阶段，病毒会产生s-HDAg蛋白，这是RNA合成所必需的，因为它能够确保通过组蛋白，模拟在病毒RNA上募集 BAZ2B 相关染色质重塑因子（BRF），这有利于DNA依赖性RNA Pol 2 劫持，并允许 Pol2 RNA 延伸过程发生。

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　　在后期生命周期阶段，由于在 amber/W 密码子上进行编辑，病毒会产生 L-HDAg，这会抑制RNA合成，并有利于病毒粒子形态发生。丁肝病毒基因组复制，高度依赖于两种形式 HDAg 各自的比例。在体外研究表明，10:1 s-HDAg/L-HDAg 比率下，复制减少了多达8倍。总之，我们发现HDVRNA编辑，是丁肝病毒生命周期中关键步骤，在人类感染的自然史和临床结果中，起着重要作用。

　　结果表明，这种新型检测技术，可以实现如下目标：尽管HDV基因组有着高度可变性，但其特征在于不同HDV之间的整个基因组序列的核苷酸差异率范围为20%至高达35%基因型；个性化长度为 251nt 的序列，Phred Quality Score > 20%，准确率 99%；正确比对每个共有序列；检查在 amber/W 密码子位置存在哪个核苷酸并表征密码子；

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　　计算编辑率并提供最终报告。法国科研人员介绍，使用这种定量方法，在感染HDV基因型为1、5、6、7和8的患者中，临床样本的编辑率值介于7%至69%之间。之前，使用HDV-1菌株进行的体外（细胞培养）与体内（血浆）研究发现，编辑率约为40%。

　　值得注意的是，在本研究的三个样本当中，科研人员反复观察到非常低的编辑率值，介于LLOD (1%) 和 LLOQ (5%) 之间。这些结果表明，只需极少量的 L-HDAg 足以产生病毒粒子。反之，具有高HDV-RNA编辑能力的菌株（如具有69%编辑能力的HDV-5菌株），31%的非编辑RNA编码 s-HDAg 的存在，似乎足以启动和继续基因组复制，并确保丁肝病毒生命周期的后续步骤。

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　　小番健康结语：医疗新技术开发和转化应用也非常重要，法国科学家最近的研究，提供了一种新的特定工具，专门用来量化体外或体内HDV编辑率，以及对HDV生命周期这一重要步骤的基因型依赖性新见解。法国科研人员认为，该工具在将来的大规模临床研究中有用，以评估编辑率作为自然感染病程和治疗反应的预测标志物作用。研究已于2021年8月9日在线发表在Viruses上。

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